中国医学科学院医药生物技术研究所创建于 1958 年，原名抗菌素研究所，是国内第一所现代化的微生物药物研究机构。
研究所“微生物与生化药学”为国家重点学科，是北京协和医学院“药学”国家一级重点学科的重要组成部分。

研究所以抗感染药物为核心，兼顾肿瘤靶向与免疫治疗，心血管、代谢类疾病等治疗药物研发，发挥资源、技术与团队优势，在微生物药物、化学合成药物及生物技术药物领域开展前瞻性、创新性研究。