1.资源勘查中心。
主要职责：承担地热资源勘查、天然矿泉水勘查、矿区水文地质勘查、水源地保护区划分、供水水源地勘查、水资源论证、地下水资源调查评价、入河排污口排查设置论证、地下水环境影响评估等水工环地质项目。

2.生态修复中心。
主要职责：承担岩土工程勘察，地质灾害排查、调查与风险区划、评估、勘查、设计，生态保护与修复，水土污染调查、评价、修复，水资源论证，水土保持方案，矿山地质环境保护与土地复垦方案、压覆矿产资源调查评价、绿色矿山建设方案，土地开发整理设计，高标准农田设计，区域地质、城市地质、农业地质调查评价；
地质遗迹调查、文物保护工程，国土空间规划、生态修复规划，地质公园申报、规划、建设；
社会稳定性评价等各类技术项目。

3.创新中心。
主要职责：创新中心承担矿山生态环境修复工程技术理论创新、制度创新、科技创新，不断催生新动力、新技术、新业态、新模式，开展生态环境修复领域的新技术研发、技术成果转化，实施水文地质勘查、地质灾害调查评价、勘查设计、矿山治理规划、土地复垦等相关项目，推进“产、学、研、用”相互支撑，提升矿山生态环境修复技术创新与应用推广水平。

4.水工环勘查中心。
主要职责：承担岩土工程勘察，地质灾害排查、调查与风险区划、评估、勘查、设计，生态保护与修复，水土污染调查、评价、修复，水资源论证，水土保持方案，矿山地质环境保护与土地复垦方案、压覆矿产资源调查评价、绿色矿山建设方案，土地开发整理设计，高标准农田设计，区域地质、城市地质、农业地质调查评价；
地质遗迹调查、文物保护工程，国土空间规划、水工环规划，地质公园申报、规划、建设；
社会稳定性评价等各类技术项目。