东部战区总医院组建于2018年11月，以原南京军区南京总医院、原第八十一医院(含八十六临床部)、原第八十二医院(含一四九临床部)、原第三五九医院为基础，纳入驻宁及周边地区机关院校15家门诊部。 医院现拥有国家、军队、军区和江苏省重点学科34个。 拥有2名中国工程院院士、1名、4名百千万人才工程人选。 先后有49人获得政府特殊津贴，17人次获得“何梁何利奖”“国家突出贡献中青年专家”“国家杰出青年基金”等重大奖项。 东部战区总医院博士后科研工作站于2000年11月设站，是军队系统首批建立的3家工作站之一，也是全国医院系统首家博士后科研工作站，2002年首批获得独立招收博士后资格。 累计招收培养博士后研究人员413名，在站博士后研究人员174名，是全国博士后科研工作站招收人数最多的单位。 医院博士后科研工作站于2005年、2010年、2015年和2020年四次被国家表彰为全国优秀博士后科研工作站，成为全国唯一一家连续四次被表彰的医学类博士后科研工作站。